MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Haemophilus influenzae R2866 chromosome

Total Repeats: 35348

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017451	ATG	2	6	20	25	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263234
2	NC_017451	GGT	3	9	37	45	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263234
3	NC_017451	TTA	2	6	100	105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263234
4	NC_017451	TGG	2	6	153	158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263234
5	NC_017451	AAG	2	6	182	187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263234
6	NC_017451	TGC	2	6	216	221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263234
7	NC_017451	CAG	2	6	269	274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386263234
8	NC_017451	CAA	2	6	364	369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386263234
9	NC_017451	CCG	2	6	604	609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386263234
10	NC_017451	ACA	2	6	651	656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386263234
11	NC_017451	TGA	2	6	699	704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263234
12	NC_017451	CAA	2	6	712	717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386263234
13	NC_017451	TA	3	6	727	732	50 %	50 %	0 %	0 %	386263234
14	NC_017451	TAA	2	6	768	773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386263234
15	NC_017451	CCAT	2	8	832	839	25 %	25 %	0 %	50 %	386263234
16	NC_017451	ATTT	2	8	883	890	25 %	75 %	0 %	0 %	386263234
17	NC_017451	ATT	2	6	1037	1042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263234
18	NC_017451	GAA	2	6	1132	1137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263234
19	NC_017451	TGG	2	6	1238	1243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263234
20	NC_017451	TAC	2	6	1313	1318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386263234
21	NC_017451	TGAT	2	8	1370	1377	25 %	50 %	25 %	0 %	386263234
22	NC_017451	TCAA	2	8	1397	1404	50 %	25 %	0 %	25 %	386263234
23	NC_017451	A	6	6	1403	1408	100 %	0 %	0 %	0 %	386263234
24	NC_017451	GCA	2	6	1442	1447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386263234
25	NC_017451	AGA	2	6	1476	1481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263234
26	NC_017451	CGT	2	6	1540	1545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263234
27	NC_017451	CTT	2	6	1571	1576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386263234
28	NC_017451	CAA	2	6	1663	1668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386263234
29	NC_017451	GAA	2	6	1669	1674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263234
30	NC_017451	AAAAAC	2	12	1679	1690	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	386263234
31	NC_017451	AAC	2	6	1772	1777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386263234
32	NC_017451	GCA	2	6	1828	1833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386263234
33	NC_017451	ATT	2	6	1840	1845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263234
34	NC_017451	A	6	6	1858	1863	100 %	0 %	0 %	0 %	386263234
35	NC_017451	GTG	2	6	2163	2168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263235
36	NC_017451	TA	3	6	2181	2186	50 %	50 %	0 %	0 %	386263235
37	NC_017451	A	6	6	2198	2203	100 %	0 %	0 %	0 %	386263235
38	NC_017451	TAAC	2	8	2241	2248	50 %	25 %	0 %	25 %	386263235
39	NC_017451	CTT	2	6	2262	2267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386263235
40	NC_017451	GGT	2	6	2273	2278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263235
41	NC_017451	GTG	2	6	2319	2324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263235
42	NC_017451	CA	3	6	2357	2362	50 %	0 %	0 %	50 %	386263235
43	NC_017451	CGT	3	9	2609	2617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263236
44	NC_017451	TTC	2	6	2637	2642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386263236
45	NC_017451	TTA	2	6	2679	2684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263236
46	NC_017451	A	6	6	2705	2710	100 %	0 %	0 %	0 %	386263236
47	NC_017451	AATC	2	8	2721	2728	50 %	25 %	0 %	25 %	386263236
48	NC_017451	ACGT	2	8	2805	2812	25 %	25 %	25 %	25 %	386263236
49	NC_017451	TCG	2	6	2833	2838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263236
50	NC_017451	TGG	2	6	2842	2847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263236
51	NC_017451	CGT	2	6	2885	2890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263236
52	NC_017451	AGC	2	6	2920	2925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386263236
53	NC_017451	GTG	2	6	2934	2939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263236
54	NC_017451	ATA	2	6	2988	2993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386263236
55	NC_017451	GCA	2	6	2999	3004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386263236
56	NC_017451	A	6	6	3008	3013	100 %	0 %	0 %	0 %	386263236
57	NC_017451	TAA	2	6	3071	3076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386263236
58	NC_017451	TAA	2	6	3152	3157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386263237
59	NC_017451	ACT	4	12	3226	3237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386263237
60	NC_017451	GCA	2	6	3295	3300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386263237
61	NC_017451	TGGA	2	8	3310	3317	25 %	25 %	50 %	0 %	386263237
62	NC_017451	ACAAGA	2	12	3318	3329	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386263237
63	NC_017451	GCA	2	6	3352	3357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386263237
64	NC_017451	TCTGG	2	10	3368	3377	0 %	40 %	40 %	20 %	386263237
65	NC_017451	CAA	2	6	3385	3390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386263237
66	NC_017451	TGG	2	6	3504	3509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263237
67	NC_017451	CTT	2	6	3606	3611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386263237
68	NC_017451	GTT	2	6	3616	3621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386263237
69	NC_017451	AGA	2	6	3681	3686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263237
70	NC_017451	TTGAT	2	10	3704	3713	20 %	60 %	20 %	0 %	386263237
71	NC_017451	GAA	2	6	3769	3774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263237
72	NC_017451	GAA	2	6	3802	3807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263237
73	NC_017451	TTG	2	6	3821	3826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386263237
74	NC_017451	AGA	2	6	3846	3851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263237
75	NC_017451	GAA	3	9	3889	3897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263237
76	NC_017451	ATT	2	6	3937	3942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263237
77	NC_017451	GTT	2	6	4000	4005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386263237
78	NC_017451	TACC	2	8	4009	4016	25 %	25 %	0 %	50 %	386263237
79	NC_017451	TGA	2	6	4086	4091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263237
80	NC_017451	TTC	2	6	4153	4158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386263237
81	NC_017451	TCGTA	2	10	4233	4242	20 %	40 %	20 %	20 %	386263237
82	NC_017451	TAA	2	6	4254	4259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386263237
83	NC_017451	GAA	2	6	4264	4269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263237
84	NC_017451	AAG	2	6	4274	4279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263237
85	NC_017451	GCT	2	6	4300	4305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263237
86	NC_017451	ACT	2	6	4324	4329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386263237
87	NC_017451	A	6	6	4436	4441	100 %	0 %	0 %	0 %	386263237
88	NC_017451	AAG	2	6	4469	4474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263237
89	NC_017451	CA	3	6	4492	4497	50 %	0 %	0 %	50 %	386263237
90	NC_017451	ATT	2	6	4519	4524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263237
91	NC_017451	TTG	2	6	4556	4561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386263237
92	NC_017451	ATG	2	6	4646	4651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263237
93	NC_017451	TGG	2	6	4677	4682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263237
94	NC_017451	TGT	2	6	4701	4706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386263237
95	NC_017451	AAC	2	6	4820	4825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386263237
96	NC_017451	AGT	2	6	4854	4859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263237
97	NC_017451	ATG	2	6	4895	4900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263237
98	NC_017451	TGC	2	6	4929	4934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263237
99	NC_017451	AGTTGA	2	12	4998	5009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263237
100	NC_017451	CGT	3	9	5053	5061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263237
101	NC_017451	AAG	2	6	5078	5083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263237
102	NC_017451	TGT	2	6	5094	5099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386263237
103	NC_017451	CAT	2	6	5177	5182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386263237
104	NC_017451	CAA	2	6	5216	5221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386263237
105	NC_017451	A	6	6	5251	5256	100 %	0 %	0 %	0 %	386263237
106	NC_017451	AAC	2	6	5398	5403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386263238
107	NC_017451	CAG	2	6	5409	5414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386263238
108	NC_017451	GGT	2	6	5444	5449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263238
109	NC_017451	AGA	2	6	5485	5490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263238
110	NC_017451	GCG	2	6	5609	5614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386263238
111	NC_017451	ATGG	2	8	5618	5625	25 %	25 %	50 %	0 %	386263238
112	NC_017451	TAG	3	9	5634	5642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263238
113	NC_017451	TTA	2	6	5684	5689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263238
114	NC_017451	CAT	2	6	5713	5718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386263238
115	NC_017451	TTA	2	6	5759	5764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263238
116	NC_017451	TAG	2	6	5769	5774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263238
117	NC_017451	GAA	2	6	5879	5884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263238
118	NC_017451	A	6	6	5883	5888	100 %	0 %	0 %	0 %	386263238
119	NC_017451	ACT	2	6	5904	5909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386263238
120	NC_017451	CCAGAA	2	12	5924	5935	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	386263238
121	NC_017451	CTT	2	6	5957	5962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386263238
122	NC_017451	GTA	2	6	6002	6007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263238
123	NC_017451	ATC	2	6	6029	6034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386263238
124	NC_017451	TGA	2	6	6043	6048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263238
125	NC_017451	TCG	2	6	6057	6062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263238
126	NC_017451	ACT	2	6	6083	6088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386263238
127	NC_017451	ATT	2	6	6154	6159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263238
128	NC_017451	GAA	2	6	6176	6181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263238
129	NC_017451	CACAC	2	10	6220	6229	40 %	0 %	0 %	60 %	386263238
130	NC_017451	TAT	2	6	6255	6260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263238
131	NC_017451	GGT	2	6	6272	6277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386263238
132	NC_017451	TTC	2	6	6290	6295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386263238
133	NC_017451	ACA	2	6	6326	6331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386263238
134	NC_017451	GTT	2	6	6485	6490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386263238
135	NC_017451	ATC	2	6	6497	6502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386263238
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139	NC_017451	TTC	2	6	6684	6689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386263239
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141	NC_017451	AC	3	6	6821	6826	50 %	0 %	0 %	50 %	386263239
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143	NC_017451	ATA	2	6	6925	6930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386263239
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153	NC_017451	CAT	2	6	7165	7170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386263240
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165	NC_017451	A	7	7	7556	7562	100 %	0 %	0 %	0 %	386263241
166	NC_017451	T	6	6	7582	7587	0 %	100 %	0 %	0 %	386263241
167	NC_017451	ATT	2	6	7670	7675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263241
168	NC_017451	TAT	2	6	7817	7822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263242
169	NC_017451	CTT	2	6	7847	7852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386263242
170	NC_017451	T	6	6	7859	7864	0 %	100 %	0 %	0 %	386263242
171	NC_017451	ATTGAT	2	12	7980	7991	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386263242
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173	NC_017451	TTA	2	6	8020	8025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263242
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237	NC_017451	TCA	2	6	12146	12151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386263248
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242	NC_017451	A	6	6	12281	12286	100 %	0 %	0 %	0 %	386263248
243	NC_017451	ACG	2	6	12313	12318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386263248
244	NC_017451	AT	3	6	12329	12334	50 %	50 %	0 %	0 %	386263248
245	NC_017451	TTC	2	6	12400	12405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386263248
246	NC_017451	AGCC	2	8	12440	12447	25 %	0 %	25 %	50 %	386263248
247	NC_017451	ATA	2	6	12476	12481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386263248
248	NC_017451	CAA	2	6	12582	12587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386263249
249	NC_017451	ATT	2	6	12597	12602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263249
250	NC_017451	CAA	2	6	12627	12632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386263249
251	NC_017451	TGC	2	6	12638	12643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263249
252	NC_017451	ATT	2	6	12650	12655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263249
253	NC_017451	GAT	2	6	12657	12662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263249
254	NC_017451	CCATT	2	10	12670	12679	20 %	40 %	0 %	40 %	386263249
255	NC_017451	AAG	2	6	12697	12702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263249
256	NC_017451	ATTT	2	8	12753	12760	25 %	75 %	0 %	0 %	386263249
257	NC_017451	AGA	2	6	12770	12775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263249
258	NC_017451	CGT	2	6	12777	12782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386263249
259	NC_017451	TGA	2	6	12824	12829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386263249
260	NC_017451	AGA	2	6	12872	12877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386263249
261	NC_017451	GAGC	2	8	12965	12972	25 %	0 %	50 %	25 %	386263249
262	NC_017451	A	6	6	12974	12979	100 %	0 %	0 %	0 %	386263249
263	NC_017451	TTA	2	6	13098	13103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386263249
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